本病是因生殖結節發育不全所致。此種病人除無陰莖外，還可能合并其他泌尿生殖器、直腸與肛門、心血管系統以及下肢畸形。因此，病人常常是短命的。對于能夠成活下來的病人來說，最好的治療方法是轉歸為女性，其手術包括睪丸切除及外陰成形等。
二、隱匿陰莖畸形
本病多見于肥胖體型的人（陰囊腫大造成者除外）。病人常因肥胖導致陰莖發育異常，出現包莖及陰莖發育短小等癥，除影響排尿外，對性生活影響也較大。其治療方法是進行綜合性減肥治療，必要時可實施陰莖成形術并輔以內分泌治療。兒童患者應盡量在青春期前完成手術。
三、雙陰莖畸形
本癥是因胚胎期陰莖始基發育障礙所引起的，常合并其他畸形，如雙膀胱、雙直腸以及肛門、脊柱等部位的畸形。因此，對雙陰莖畸形要做全面的體格檢查，以得出全面的診斷。治療單純性雙陰莖畸形比較簡單，可保留較粗壯的一側而將另一側切除。
四、小陰莖畸形
治療此類病人可依下列原則進行：1、首先解除病人的排尿困難，應盡早實施尿道整形術。2、進行內分泌治療，雄性激素開始使用的時間越早，其治療效果越好。3、在必要的情況下，可進行小陰莖增大整形術或改變性別的手術。
五、大陰莖畸形
大陰莖畸形者的陰莖長度和直徑均較正常者大，國內曾報道有陰莖長度達18 cm，根部直徑達3.5 cm，陰莖頭長3.5 cm，頭部直徑達5.5 cm者。大陰莖畸形病人還常常合并內分泌系統的其他疾病。治療這種病人一般是采用部分切除陰莖海綿體的縮小手術。
六、陰囊的先天畸形
陰囊的先天畸形比較少見，其發病原因尚不十分清楚。它常與其他生殖器畸形同時存在。根據文獻報道，陰囊部的畸形主要有先天性無陰囊、陰囊發育不全、陰囊異位以及陰囊裂等數種。其治療方法為視情況選擇不同的整形手術。
七、陰莖的彎曲畸形
本病病人的主要癥狀是陰莖彎曲，同時伴有排尿及性生活障礙。其治療方法主要是實施包括切除影響陰莖伸直組織在內的陰莖整形術。
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