非淋菌性尿道炎與男性不育。前列腺分泌的液體是組成精液的主要內容。尿道起自膀胱，向下而行，上面有精囊管開口，再下面有許多前列腺開口，然后就進入陰莖，最后開口于龜頭。性生活高潮射精時，精囊和前列腺都會收縮，這樣就會把儲存在精囊里面的精子和前列腺液一起排出，這就是射精時排出的精液。
尿道是排尿和射精的共用通道，如果尿道發生感染，除了引起泌尿系統癥狀外，對生殖功能也會產生影響。非淋菌性尿道炎(NGU)是男性常見的尿道感染性疾病,主要的傳播途徑是經過性生活，所以也屬于性傳播疾病。其主要致病的病原體有細菌、衣原體、支原體、滴蟲和單純皰疹病毒等。非淋菌性尿道炎的典型的癥狀是尿道分泌物增多、尿痛、尿道發癢。一般潛伏期為1-5周，性接觸后2-3周是發病高峰。尿痛輕重不等，尿道分泌物有時量很少，呈粘液狀，多于清晨出現，有時于尿道口形成結痂；有時分泌物量很多，呈膿性；也有的病人毫無癥狀。
在不育夫婦中，特別是那些所謂不明原因的不育夫婦中，男性精液中衣原體和支原體等病原體存在的比例遠遠高于正常人，因此可以認為這些病原體是導致不育的因素之一。非淋菌性尿道炎一般通過下面這些途徑影響男性的生育能力： 因尿道炎導致尿道狹窄和射精功能障礙。尿道感染可以直接影響尿道的上皮，在感染的局部形成疤痕。這種情況嚴重時可造成尿道狹窄，造成排尿困難，同時也可以造成射精的障礙。
尿道鄰近器官的感染。附睪是運輸精子的管道，如果發生附睪炎，可造成梗阻，使得精子不能運送出睪丸。前列腺液是組成精液的主要成分，如果發生前列腺炎，精液里面就可能有大量白細胞。在精液常規檢查中，如果精液中每高倍顯微鏡視野下白細胞個數超過5個，就是不正常，將導致不育。
誘發產生抗精子抗體。衣原體和支原體等可誘導人體產生抗體，而這些抗體與精子有交叉，因此可能會誘導人自身產生抗精子抗體，從而造成不育。 對精子的直接作用。支原體是一種很微小的生物，可以吸附在精子中部，影響精子的活力。曾經有人對支原體陽性的男性采用針對性治療后發現，精子的各項指標均有明顯提高，妊娠率也有提高。
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